L'australiano Jack Miller è stato il più veloce nel warm up di Assen. Il portacolori Estrella Galicia e vincitore del GP olandese del 2016 chiude il miglior passaggio della mattinata in 1:51.203. Una sessione contrassegnata dall'arrivo della pioggia che ha di fatto praticamente annullato il warm up dove hanno provato solo pochi piloti, con grande prudenza. Dietro a Miller si posiziona Marc Marquez (Honda) a 0,017 con Andrea Iannone (Suzuki) al terzo posto con un ritardo di 0,637. Valentino Rossi e Maverick Viales (Yamaha) hanno chiuso al 10mo e 7mo posto mentre Jorge Lorenzo, Andrea Dovizioso (Ducati) e Danilo Petrucci (Octo Pramac Racing) non hanno preso parte alla sessione.